Mac版のLINEではスタンプの削除機能がありません。力業を発揮するしかないようです。

ちなみに収納場所は、
/Users/ユーザー名/Library/Containers/jp.naver.line.mac/Data/Library/Containers/jp.naver.line/Data/Sticker/ 

で、この下のディレクトリのどこかにあると思います。私の場合は 1396489 でしたが、もしかすると他の番号かもしれません。

ただし、そのディレクトリを削るだけでは足りなくて、さらにいろいろ調べてデータを削除しなければいけないようです。取り急ぎ、私は 1396489 の中身だけ削除し、ディレクトリのオーナーを変更することで読み込めないようにして、いらないスタンプが出てこないようにしました。

アプリを起動すると、人の顔のアイコンがあり、そこをクリックすると何か読み込んでいるようですがスタンプは出てきません。とりあえず、めでたし、めでたし。